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我國研發(fā)CoHIT檢測平臺:一種簡便、快速、精準(zhǔn)的CRISPR基因檢測技術(shù)
2024年06月27日 16:04:42 來源:化工儀器網(wǎng) 點擊量:9017

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研發(fā)一種名為CoHIT的新型CRISPR檢測平臺,該平臺能夠快速、精準(zhǔn)地檢測同一基因位點上多種不同類型的突變(indels)。

  【化工儀器網(wǎng) 項目成果】中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室深圳分中心)攜手武漢大學(xué)中南醫(yī)院,在《自然·通訊(Nature Communications)》期刊上發(fā)表了一項重大研究成果。該論文題為“CoHIT: a one-pot ultrasensitive ERA-CRISPR system for detecting multiple same-site indels”,介紹了一種名為CoHIT的新型CRISPR檢測平臺,該平臺能夠快速、精準(zhǔn)地檢測同一基因位點上多種不同類型的突變(indels)。
 
  快速靈敏檢測技術(shù)對疾病防控必不可少近年來,以CRISPR/Cas為代表的基因編輯技術(shù)帶來了生物技術(shù)革命性的進步。CRISPR的核酸檢測技術(shù)因其快速、準(zhǔn)確、靈敏、經(jīng)濟等特點,正在引發(fā)分子診斷革新,并已被成功應(yīng)用于傳染病、遺傳病、腫瘤基因突變診斷,以及食品安全等領(lǐng)域。
 
  但現(xiàn)有的檢測方法在應(yīng)對同一基因位點的多種indels時往往存在檢測覆蓋率不足的局限性。為了克服這一挑戰(zhàn),研究團隊利用蛋白進化技術(shù),篩選出高耐受度的Cas蛋白,并結(jié)合單一crRNA識別多種突變類型的創(chuàng)新理念,成功構(gòu)建了CoHIT檢測平臺。
 
  CoHIT系統(tǒng)的核心在于一種改良的AsCas12a蛋白,即enAsU-R。這種蛋白僅需一條crRNA就能靶向多個不同的變異體,有效提高了檢測的靈敏度和特異性。通過一系列參數(shù)優(yōu)化,CoHIT技術(shù)對NPM1基因突變的常見亞型達到了0.01%的檢測靈敏度,并在30分鐘內(nèi)快速給出結(jié)果,為急性髓系白血病(AML)患者的NPM1突變檢測提供了新的解決方案,且在監(jiān)測微小殘留病灶(MRD)方面展現(xiàn)了巨大的潛力。
 
  值得一提的是,CoHIT技術(shù)還具備出色的適應(yīng)性和多重檢測能力。通過與側(cè)向流檢測條(LFA)和微流控芯片的結(jié)合,該技術(shù)不僅實現(xiàn)了現(xiàn)場快速檢測,還能夠在一次上樣中同時檢測多個靶標(biāo),為疾病的早期診斷和食品安全監(jiān)測等領(lǐng)域提供了強大的技術(shù)支持。
 
  CoHIT技術(shù)的成功研發(fā)和不斷優(yōu)化,不僅簡化了檢測流程,還大大提升了檢測速度與準(zhǔn)確性,為分子育種、疾病早期診斷、遺傳病篩查和食品安全監(jiān)測等眾多領(lǐng)域提供了強有力的工具。
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