散彈槍法和靶向蛋白質(zhì)組學的比較分析

散彈槍法和靶向蛋白質(zhì)組學的比較分析檢測技術服務詳情介紹

在現(xiàn)代蛋白質(zhì)組學研究中，如何選擇適當?shù)馁|(zhì)譜策略，直接影響數(shù)據(jù)的深度、準確性以及研究成果的可轉(zhuǎn)化潛力。研究初期通常需要開展廣覆蓋的探索性分析，此時可選用發(fā)現(xiàn)型蛋白質(zhì)組學（Discovery Proteomics，又稱“散彈槍法”）；而在候選靶點篩選完成后，研究重點將轉(zhuǎn)向高特異性、高重復性的驗證階段，靶向蛋白質(zhì)組學（Targeted Proteomics）便成為shǒuxuǎn技術路徑。本文將從技術原理、數(shù)據(jù)特征、適用場景及優(yōu)劣比較等方面，系統(tǒng)對比這兩種策略，并介紹百泰派克生物科技如何協(xié)助科研人員高效整合二者，提升整體研究效率與成果轉(zhuǎn)化率。

一、原理差異：探索式 vs 驗證式

1、散彈槍法Shotgun Proteomics：大規(guī)模無偏探索

散彈槍法（Shotgun Proteomics）也稱發(fā)現(xiàn)型蛋白質(zhì)組學（Discovery Proteomics），主要采用數(shù)據(jù)依賴采集（DDA）策略。利用LC-MS/MS系統(tǒng)對樣本中所有可檢測肽段進行隨機采集和數(shù)據(jù)庫匹配。強調(diào)覆蓋度與蛋白識別數(shù)量，適合未知機制的初篩探索。

2、靶向蛋白質(zhì)組學：jīngzhǔn定量的“jūjī手”

采用MRM或PRM方式，僅檢測預設的特定肽段。樣本中所有信息被忽略，質(zhì)譜僅關注“感興趣目標”。數(shù)據(jù)可重復、定量穩(wěn)定，適合驗證候選標志物或疾病靶點。

二、比較分析：一張表看懂兩大策略差異

三、應用場景：不是替代，而是互補

1、散彈槍法的典型應用

（1）大規(guī)模篩選疾病相關差異蛋白（如腫瘤 vs 正常組織）

（2）研究生物通路、蛋白互作網(wǎng)絡

（3）快速生成新假設，識別潛在生物標志物

2、靶向蛋白質(zhì)組學的典型應用

（1）驗證候選蛋白在獨立樣本中的表達趨勢

（2）建立伴隨診斷模型，支持臨床決策

（3）實現(xiàn)關鍵蛋白的juéduì定量，用于藥效評價

百泰派克生物科技整合解決方案：讓技術更貼近研究目標

百泰派克生物科技整合多種質(zhì)譜策略，幫助科研人員根據(jù)項目需求靈活選擇：

• 發(fā)現(xiàn)階段：支持Shotgun + DIA數(shù)據(jù)獲取

• 驗證階段：定制MRM/PRM靶點設計與方法開發(fā)

• 定量階段：SIS肽合成與juéduì定量

• 數(shù)據(jù)分析：支持網(wǎng)絡分析、通路富集、可視化展示

我們不僅提供平臺，更提供“策略+分析+轉(zhuǎn)化”的一站式服務。Shotgun和靶向蛋白質(zhì)組學并非二選一，而是一個連續(xù)的研究閉環(huán)：從全面掃描，到jīngzhǔn鎖定，再到臨床可轉(zhuǎn)化。關鍵在于，研究者如何在正確的時間節(jié)點，選擇合適的技術策略。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對蛋白質(zhì)序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測序法的蛋白質(zhì)從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學、靶向蛋白質(zhì)組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質(zhì)組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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