Edman降解 vs 質(zhì)譜：蛋白質(zhì)測(cè)序技

Edman降解 vs 質(zhì)譜：蛋白質(zhì)測(cè)序技術(shù)對(duì)比（二）檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

dànbáizhì作為細(xì)胞功能的核心執(zhí)行者，其氨基酸序列信息不僅揭示其結(jié)構(gòu)與功能，還為生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)、抗體鑒定、疫苗設(shè)計(jì)等應(yīng)用提供基礎(chǔ)。dànbáizhì測(cè)序，作為解析氨基酸組成與排列的關(guān)鍵技術(shù)，歷經(jīng)數(shù)十年發(fā)展，主要形成了兩種主流路徑：Edman降解法與質(zhì)譜（Mass Spectrometry, MS）法。那么，這兩種dànbáizhì測(cè)序技術(shù)各有何優(yōu)勢(shì)，又適用于哪些研究場(chǎng)景？本文將為您全面對(duì)比解析。

一、什么是Edman降解？

Edman降解是由Pehr Edman于1950年開(kāi)發(fā)的一種經(jīng)典dànbáizhì測(cè)序技術(shù)，原理是通過(guò)化學(xué)方式依次從N端切割出氨基酸，并加以鑒定，從而一步步推斷蛋白序列。

1、核心機(jī)制

（1）PITC標(biāo)記：苯異硫氰酸酯（PITC）與N端氨基酸反應(yīng)形成環(huán)狀衍生物；

（2）酸解切除：釋放出dìyī個(gè)氨基酸衍生物（PTH-aa）；

（3）高效液相色譜（HPLC）分析：鑒定該氨基酸種類；

（4）重復(fù)上述步驟，逐個(gè)讀取氨基酸。

2、優(yōu)點(diǎn)

（1）高保真度，適用于序列已知或抗體驗(yàn)證；

（2）適用于純化程度高的dànbáizhì；

（3）對(duì)序列中氨基酸修飾不敏感。

3、局限

（1）通常只能測(cè)定前30–50個(gè)氨基酸；

（2）要求樣品純度高，量大；

（3）對(duì)C端及中段序列無(wú)能為力；

（4）無(wú)法識(shí)別翻譯后修飾（PTMs）。

二、什么是質(zhì)譜蛋白測(cè)序？

質(zhì)譜法測(cè)序是通過(guò)對(duì)dànbáizhì或肽段的質(zhì)量-電荷比（m/z）進(jìn)行jīngquè測(cè)定，結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)搜索或de novo算法，實(shí)現(xiàn)蛋白序列解析的現(xiàn)代技術(shù)路徑。

1、核心流程

（1）蛋白酶切：如yídànbáiméi水解蛋白成小肽；

（2）LC-MS/MS分析：液相色譜分離 + 串聯(lián)質(zhì)譜碎裂肽段；

（3）數(shù)據(jù)庫(kù)匹配或de novo算法推斷序列。

2、優(yōu)點(diǎn)

（1）高通量：可同時(shí)測(cè)定上千種dànbáizhì；

（2）靈敏度高：納克級(jí)甚至皮克級(jí)樣本也能測(cè)序；

（3）識(shí)別翻譯后修飾：如磷酸化、乙酰化、糖基化等；

（4）適配復(fù)雜樣本：如細(xì)胞裂解液、組織提取物、血漿等。

3、局限

（1）對(duì)小肽（< 5 aa）難以解析；

（2）de novo算法結(jié)果需驗(yàn)證，存在一定不確定性；

（3）復(fù)雜修飾、異構(gòu)體可能增加鑒定難度。

三、二者比較一覽

四、dànbáizhì測(cè)序技術(shù)選擇建議

若您手頭擁有高純度單一蛋白，并希望驗(yàn)證其N端序列或抗體片段，Edman降解仍具價(jià)值；

若您關(guān)注整體蛋白表達(dá)譜、翻譯后修飾、或進(jìn)行未知蛋白序列測(cè)定，質(zhì)譜法則是更現(xiàn)代、高效的選擇。

在dànbáizhì測(cè)序需求日益增長(zhǎng)的jīntiān，選擇可靠的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)至關(guān)重要。百泰派克生物科技依托優(yōu)良的Orbitrap與Q-TOF質(zhì)譜平臺(tái)，提供涵蓋N/C端測(cè)序、de novo肽段測(cè)序、翻譯后修飾分析等多樣化服務(wù)。我們不僅滿足科研人員的基礎(chǔ)需求，更助力生物醫(yī)藥企業(yè)推進(jìn)抗體藥物研發(fā)、疫苗驗(yàn)證與創(chuàng)新蛋白設(shè)計(jì)。無(wú)論您是科研單位、醫(yī)院研究者，還是生物醫(yī)藥企業(yè)，歡迎聯(lián)系我們，一站式解決dànbáizhì測(cè)序難題。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，N端測(cè)序，C端測(cè)序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

Edman降解 vs 質(zhì)譜：蛋白質(zhì)測(cè)序技術(shù)對(duì)比（二）檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹