蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)識(shí)別與功能預(yù)測(cè)的整合解決方案

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)識(shí)別與功能預(yù)測(cè)的整合解決方案檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在后基因組時(shí)代，理解dànbáizhì的三維結(jié)構(gòu)和功能是揭示生命奧秘的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。dànbáizhì不僅是細(xì)胞的基本執(zhí)行單元，其結(jié)構(gòu)和功能的解析亦是新藥研發(fā)、疾病機(jī)制研究以及jīngzhǔn醫(yī)療的核心基礎(chǔ)。目前，X射線晶體學(xué)、核磁共振（NMR）和冷凍電鏡（Cryo-EM）等經(jīng)典結(jié)構(gòu)生物學(xué)方法在精度方面具有顯著優(yōu)勢(shì)，但通常面臨周期長(zhǎng)、實(shí)驗(yàn)條件苛刻、對(duì)樣品純度和穩(wěn)定性依賴性強(qiáng)等挑戰(zhàn)。因此，構(gòu)建高通量、自動(dòng)化的結(jié)構(gòu)識(shí)別與功能預(yù)測(cè)整合方案，正成為生命科學(xué)研究的關(guān)鍵方向。

一、dànbáizhì結(jié)構(gòu)識(shí)別：從序列走向結(jié)構(gòu)的科學(xué)路徑

dànbáizhì結(jié)構(gòu)分為四個(gè)層級(jí)：一級(jí)序列、二級(jí)結(jié)構(gòu)（α-螺旋、β-折疊等）、三級(jí)結(jié)構(gòu)（完整空間構(gòu)象）、四級(jí)結(jié)構(gòu)（多亞基復(fù)合體）。目前主流結(jié)構(gòu)識(shí)別路徑主要依賴以下幾類方法：

1、同源建模與模板比對(duì)

通過(guò)對(duì)比已知結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)中的同源蛋白序列，可推測(cè)目標(biāo)蛋白的三維構(gòu)象。該方法依賴于目標(biāo)蛋白與模板蛋白間的序列相似性，是結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的“黃金起點(diǎn)”。

2、去模板建模（Ab Initio 方法）

當(dāng)缺乏可靠模板時(shí)，Ab Initio 模型基于物理化學(xué)原理和進(jìn)化信息預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)，盡管精度相對(duì)較低，但在未知結(jié)構(gòu)探索中具有bùkětìdài的價(jià)值。

3、深度學(xué)習(xí)輔助預(yù)測(cè)

近年來(lái)，AI 驅(qū)動(dòng)的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工具取得重大突破，可在不依賴同源模板的前提下，基于多序列比對(duì)和殘基接觸預(yù)測(cè)，快速生成高置信度結(jié)構(gòu)模型。這標(biāo)志著結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)正從經(jīng)驗(yàn)規(guī)則走向數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的新范式。

二、dànbáizhì功能預(yù)測(cè)：從結(jié)構(gòu)走向生物學(xué)意義

結(jié)構(gòu)即功能。dànbáizhì的空間構(gòu)象直接決定其功能屬性，因此基于結(jié)構(gòu)的功能預(yù)測(cè)成為研究重點(diǎn)。整合多源信息的生物信息學(xué)工具正在重塑功能預(yù)測(cè)的效率與準(zhǔn)確性。

1、活性位點(diǎn)與結(jié)構(gòu)域識(shí)別

結(jié)構(gòu)域（domain）是dànbáizhì的功能單元。通過(guò)結(jié)構(gòu)比對(duì)與已知結(jié)構(gòu)注釋，可以識(shí)別潛在的酶活性位點(diǎn)、結(jié)合口袋、轉(zhuǎn)運(yùn)通道等關(guān)鍵區(qū)域。

2、分子對(duì)接與功能注釋

結(jié)合小分子對(duì)接、蛋白-蛋白互作預(yù)測(cè)等方法，可進(jìn)一步推斷其潛在底物、配體或調(diào)控機(jī)制，支持藥物靶點(diǎn)篩選和功能驗(yàn)證。

3、網(wǎng)絡(luò)與系統(tǒng)生物學(xué)整合

結(jié)構(gòu)和功能信息若脫離系統(tǒng)環(huán)境，將難以實(shí)現(xiàn)完整理解。因此，越來(lái)越多研究將結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果整合進(jìn)dànbáizhì互作網(wǎng)絡(luò)、信號(hào)通路分析、以及多組學(xué)協(xié)同解釋中，實(shí)現(xiàn)由點(diǎn)到面的功能詮釋。

三、整合式解決方案：打通“序列-結(jié)構(gòu)-功能”閉環(huán)

為了提升結(jié)構(gòu)識(shí)別與功能預(yù)測(cè)的效率和可靠性，科研人員亟需一套系統(tǒng)化的解決方案，從序列輸入到功能注釋輸出，實(shí)現(xiàn)流程自動(dòng)化、結(jié)果高可信。

※ 關(guān)鍵環(huán)節(jié)包括：

• 序列預(yù)處理與質(zhì)量控制：去除低質(zhì)量序列、剪裁信號(hào)肽、統(tǒng)一命名格式；

• 結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)引擎選擇與參數(shù)優(yōu)化：根據(jù)目標(biāo)蛋白特性，選擇zuì適合的建模工具并設(shè)定優(yōu)化參數(shù)；

• 結(jié)構(gòu)注釋與功能映射整合：結(jié)構(gòu)域識(shí)別、功能位點(diǎn)注釋、GO term 或 KEGG 通路關(guān)聯(lián)；

• 多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)動(dòng)：與轉(zhuǎn)錄組、代謝組或蛋白互作組數(shù)據(jù)聯(lián)動(dòng)分析，提升功能注釋的上下文準(zhǔn)確性；

• 可視化輸出與報(bào)告生成：自動(dòng)生成結(jié)構(gòu)圖譜、功能注釋報(bào)告，便于項(xiàng)目交付與科研交流。

四、應(yīng)用場(chǎng)景與jiàzhítǐxiàn

• 靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證：預(yù)測(cè)蛋白結(jié)構(gòu)和功能位點(diǎn)，支持新靶點(diǎn)篩選；

• 突變功能研究：評(píng)估結(jié)構(gòu)變異對(duì)功能的影響，解釋疾病機(jī)制；

• 生物制劑設(shè)計(jì)：優(yōu)化蛋白穩(wěn)定性與活性，提升候選藥物成功率；

• 功能未知蛋白注釋：為高通量組學(xué)數(shù)據(jù)中的“灰色蛋白”賦予生物學(xué)意義。

dànbáizhì結(jié)構(gòu)識(shí)別與功能預(yù)測(cè)正逐步從“單點(diǎn)工具”走向“整合平臺(tái)”，其科學(xué)價(jià)值和應(yīng)用潛力正在被不斷放大。百泰派克生物科技致力于提供高效、可靠的dànbáizhì結(jié)構(gòu)鑒定服務(wù)，助力您更更深入地探索dànbáizhì世界的結(jié)構(gòu)奧秘與功能本質(zhì)。歡迎聯(lián)系我們，了解更多定制化服務(wù)方案。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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