如何利用LC-MS/MS進行高通量肽組學(xué)

如何利用LC-MS/MS進行高通量肽組學(xué)分析？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

肽組學(xué)（Peptidomics）是研究生物樣本中天然存在的內(nèi)源性肽段（通常小于10 kDa）的科學(xué)領(lǐng)域。這些肽段廣泛參與神經(jīng)調(diào)節(jié)、免疫應(yīng)答、激素信號、代謝控制等生理活動，具有重要的功能性和潛在標(biāo)志物價值。相比蛋白組學(xué)，肽組學(xué)更貼近dànbáizhì實際裂解、加工和翻譯后修飾的狀態(tài)，能敏銳反映生物系統(tǒng)的動態(tài)調(diào)控。但由于肽段短、豐度低、異構(gòu)多，研究難度較高。

為克服這些挑戰(zhàn)，液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜（LC-MS/MS）成為高通量肽組學(xué)分析中zuì關(guān)鍵的技術(shù)平臺。它不僅能jīngzhǔn識別肽段序列，還可實現(xiàn)高通量、廣覆蓋、多樣本并行的表達差異分析。

一、LC-MS/MS在高通量肽組學(xué)分析中的角色定位

1、什么是LC-MS/MS？

（1）LC（Liquid Chromatography）：將復(fù)雜肽段混合物分離，按親水性/疏水性順序進入質(zhì)譜，提高識別率

（2）MS（Mass Spectrometry）：測定肽段的質(zhì)量（m/z），初步判斷其分子量

（3）MS/MS（Tandem MS）：將目標(biāo)肽段碎裂，再次檢測其碎片模式，從而推斷氨基酸序列

在肽組學(xué)中，LC-MS/MS技術(shù)實現(xiàn)了從復(fù)雜生物樣本中分離、識別、定量內(nèi)源肽段的全過程。

二、高通量肽組學(xué)分析完整流程解析

1、樣本收集與肽段富集

內(nèi)源性肽段廣泛存在于以下樣本中：

（1）血清 / 血漿

（2）尿液

（3）腦脊液

（4）組織勻漿

（5）細胞上清或裂解液

富集方法：

百泰派克采用多策略組合富集方案，提升短肽、多肽修飾種類的捕獲效率。

2、液相色譜分離（LC）

內(nèi)源性肽段種類繁多，保留行為復(fù)雜，LC階段主要任務(wù)是在進入質(zhì)譜前按理化性質(zhì)將肽段分離，提高鑒定深度。

（1）使用納升流量nanoLC系統(tǒng)（如EASY-nLC 1200）提高靈敏度

（2）常用C18反相色譜柱，緩沖體系為水-乙腈梯度洗脫

（3）分離時間通常為60–120分鐘，以平衡通量與深度

3、串聯(lián)質(zhì)譜采集（MS/MS）

常見質(zhì)譜采集模式：

百泰派克支持DDA+DIA聯(lián)合采集，結(jié)合肽組數(shù)據(jù)庫輔助識別，提升肽段解析效率。

4、數(shù)據(jù)處理與肽段識別

（1）數(shù)據(jù)庫搜索

* 使用如 PEAKS、MaxQuant、Spectronaut 等工具進行肽段匹配

• 可接入UniProt、Swiss-Prot、RefSeq 等數(shù)據(jù)庫

• 支持定制搜索非典型起始肽、修飾肽、剪接肽段

（2）定量分析

* Label-free、iTRAQ、TMT 等定量方式可選擇

• 差異肽段篩選：fold change + P 值 + FDR（jiǎfā現(xiàn)率）控制

（3）功能注釋

* GO富集、KEGG通路映射、蛋白-肽段反向追蹤

• 可構(gòu)建“肽段-母體蛋白-功能通路”三級網(wǎng)絡(luò)

三、LC-MS/MS在高通量肽組學(xué)分析中的技術(shù)優(yōu)勢

四、LC-MS/MS肽組學(xué)的科研應(yīng)用

神經(jīng)科學(xué)：分析神經(jīng)遞質(zhì)肽、記憶調(diào)控肽段（如神經(jīng)肽Y）

腫瘤研究：識別腫瘤相關(guān)裂解肽段、新抗原或微環(huán)境信號肽

免疫學(xué)：結(jié)合HLA肽組學(xué)，解析免疫識別機制

代謝紊亂：發(fā)現(xiàn)內(nèi)分泌調(diào)節(jié)肽與代謝通路關(guān)聯(lián)

藥效學(xué)研究：監(jiān)測藥物干預(yù)前后肽段表達動態(tài)變化

五、百泰派克生物科技：高通量肽組學(xué)分析全流程服務(wù)

作為國內(nèi)lǐngxiān的多組學(xué)平臺服務(wù)商，百泰派克提供從樣本到結(jié)論的一站式LC-MS/MS肽組學(xué)研究服務(wù)，包括：

? 多樣本類型處理（組織、液體、細胞等）

? 富集策略優(yōu)化與磁珠方案定制

? 高分辨LC-MS/MS平臺（Orbitrap Exploris、Q Exactive等）

? DDA、DIA、PRM等采集模式任選組合

? 多維度差異分析 + 通路富集 + 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

? 支持與蛋白組、代謝組、轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析

肽組學(xué)為理解復(fù)雜生物過程提供了更高維的窗口，而LC-MS/MS正是將這些肽段從混沌中分離、識別、定量的“核心wǔqì”。它讓我們能夠走近真實的蛋白加工過程、功能片段表達譜與病理調(diào)控機制。百泰派克生物科技將繼續(xù)依托*的質(zhì)譜平臺、經(jīng)驗豐富的生信團隊和嚴(yán)謹(jǐn)?shù)姆?wù)體系，幫助科研人員zuì大限度釋放高通量肽組學(xué)分析的科學(xué)價值。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)*，填補技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標(biāo)同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

如何利用LC-MS/MS進行高通量肽組學(xué)分析？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹