ABPP如何支持高通量化合物篩選？

ABPP如何支持高通量化合物篩選？檢測技術服務詳情介紹

在藥物發(fā)現(xiàn)的早期階段，研究者往往需要在數(shù)百甚至上千個候選化合物中篩選出具備良好活性、特異性和安全性的分子。然而，傳統(tǒng)篩選方法如酶活性抑制實驗、結合親和分析等，雖然高通量，但缺乏靶點層面的直接功能讀數(shù)，無法提供分子在細胞或體內“真實起作用”的證據(jù)。

活性位點探針dànbáizhì譜（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）正在成為藥物篩選的重要輔助工具。其優(yōu)勢在于不僅能在復雜生物系統(tǒng)中驗證靶點結合的功能效果，還能在全蛋白組尺度評估潛在脫靶風險，為高通量化合物篩選帶來qiánsuǒwèiyǒu的分辨率和可靠性。

一、什么是ABPP？為什么它適合用于高通量化合物篩選？

ABPP 是一種利用共價活性探針特異性標記dànbáizhì活性位點，并通過高分辨率質譜進行檢測的技術。相比于蛋白組學，ABPP聚焦于“功能蛋白”——即那些在特定生物狀態(tài)中真正處于活躍狀態(tài)、發(fā)揮生物學效應的酶類蛋白。

對于藥物篩選而言，ABPP可實現(xiàn)：

1、功能性靶點驗證：判斷小分子是否真正影響目標酶的活性；

2、脫靶譜監(jiān)測：分析分子是否誤傷其他酶類蛋白；

3、基于功能蛋白組的篩選維度：避免僅靠表達量或結構親和力做判斷。

二、ABPP在高通量化合物篩選中的核心應用場景

1、靶點抑制效果評估：競爭型ABPP（Competitive ABPP）

ABPP的一項重要策略是競爭結合實驗，用于評估候選化合物是否與目標蛋白活性位點發(fā)生相互作用。

實驗原理如下：

（1）樣本（細胞或裂解液）先與化合物孵育；

（2）添加活性探針與酶結合；

（3）若化合物占據(jù)了活性位點，則探針結合減少；

（4）通過質譜定量被探針標記的蛋白，評估“抑制程度”。

優(yōu)勢： 直接驗證功能性結合，不依賴表達量或假設機制。

2、脫靶效應全面評估：功能蛋白組譜監(jiān)測

在藥物研發(fā)中，脫靶是臨床失敗的重要原因之一。ABPP可一次性檢測多個酶類蛋白活性，提供候選分子影響下的活性蛋白全景圖譜。

（1）能同時監(jiān)測幾十甚至上百個靶點級酶類；

（2）發(fā)現(xiàn)隱藏脫靶風險；

（3）輔助化合物結構優(yōu)化和選擇性增強。

3、基于活性變化的候選分子篩選平臺

ABPP不僅用于驗證已有化合物，也可用于構建活性變化驅動的篩選體系：

（1）利用高通量LC-MS/MS檢測化合物處理后活性蛋白圖譜；

（2）識別出能調節(jié)特定病理相關酶活性的分子；

（3）與表型數(shù)據(jù)聯(lián)動，提升篩選精度。

應用方向：適用于抗腫瘤、抗炎、神經系統(tǒng)疾病等方向的功能性化合物篩選。

三、ABPP篩選流程如何開展？（推薦實驗設計）

四、百泰派克生物科技ABPP藥物篩選平臺

作為國內lǐngxiān的dànbáizhì組學服務提供方，百泰派克生物科技已建立成熟的ABPP藥物篩選平臺，具備以下優(yōu)勢：

1、覆蓋多類型酶類探針庫（支持sīānsuān酶、半guāngānsuān酶、HDAC等）

2、競爭型ABPP標準流程，適配高通量化合物評估

3、結合TMT/DIA定量技術，提升活性譜分辨率與數(shù)據(jù)可比性

4、提供脫靶譜圖、熱圖、通路分析、靶點建議一站式報告

5、高通量能力支持一次性篩選幾十個化合物組合

ABPP不僅能識別誰“表達”，更告訴我們誰“在工作”，為jīngzhǔn藥物設計提供堅實依據(jù)。如果你正在尋找一套更智能、更可靠的候選分子篩選方式，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技，我們將為你定制基于ABPP的高通量化合物篩選解決方案，用“活性組”驅動下一代藥物發(fā)現(xiàn)。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術*，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

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