肽測序如何助力生物標(biāo)志物開發(fā)？

肽測序如何助力生物標(biāo)志物開發(fā)？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

肽測序是基于質(zhì)譜數(shù)據(jù)推斷肽段氨基酸序列的技術(shù)，分為兩類方法：其一是基于數(shù)據(jù)庫的序列比對，適用于已有參考dànbáizhì組的物種；其二是脫新測序（de novo sequencing），不依賴任何數(shù)據(jù)庫，直接解析MS/MS譜圖中的離子碎片，適用于未注釋蛋白或復(fù)雜樣本。相較于僅依賴mRNA或蛋白定量信息的方法，肽測序能直接提供序列層面的證據(jù)，尤其在識別剪接異構(gòu)體、突變位點(diǎn)及翻譯后修飾等方面，展現(xiàn)出dútè的研究價(jià)值。這些分子特征往往是高價(jià)值生物標(biāo)志物的核心構(gòu)成。

一、助力標(biāo)志物開發(fā)的三個(gè)關(guān)鍵維度

1、jīngquè識別差異性肽段

肽測序能夠從復(fù)雜背景中jīngquè篩選出在疾病狀態(tài)下特異表達(dá)或發(fā)生修飾變化的肽段，涵蓋非經(jīng)典剪接形式、點(diǎn)突變肽以及信號肽缺失等結(jié)構(gòu)變體。這類差異往往無法通過傳統(tǒng)的蛋白定量策略識別，卻在疾病表型形成中具有決定性作用。在實(shí)際研究中，常規(guī)蛋白定量只能定位到“蛋白層”，而真正參與調(diào)控的往往是“肽段級”的局部結(jié)構(gòu)變化。肽測序的引入，使得標(biāo)志物開發(fā)邁向更具功能相關(guān)性和結(jié)構(gòu)jīngzhǔn性的方向。

2、支持未知蛋白和非模式物種的研究

對于外泌體、微生物組、人類腫瘤樣本等復(fù)雜體系，常存在大量數(shù)據(jù)庫未收錄的dànbáizhì。此時(shí)，依賴數(shù)據(jù)庫的分析方法將難以覆蓋全部生物信息。而de novo肽測序技術(shù)可在無數(shù)據(jù)庫參考的條件下直接構(gòu)建肽段序列，為研究新型抗原、嵌合蛋白、融合肽段等提供技術(shù)支持。這對于miǎnyìzhìliáo靶點(diǎn)篩選、新型疫苗研發(fā)或物種特異標(biāo)志物的開發(fā)尤其關(guān)鍵。隨著脫新測序算法的優(yōu)化，其可靠性和覆蓋率已大幅提升，可作為數(shù)據(jù)庫搜索的有力補(bǔ)充，拓展標(biāo)志物研究邊界。

3、連接篩選與驗(yàn)證的關(guān)鍵橋梁

候選標(biāo)志物的提出只是起點(diǎn)，更關(guān)鍵的是在真實(shí)樣本中進(jìn)行序列驗(yàn)證與表達(dá)水平確認(rèn)。肽測序結(jié)合靶向質(zhì)譜（如PRM、MRM）可實(shí)現(xiàn)目標(biāo)肽段的高靈敏度定量檢測，確保其在多樣本間具有穩(wěn)定表達(dá)與可重復(fù)性，滿足臨床轉(zhuǎn)化的基本條件。此外，肽測序還能用于確認(rèn)所選靶點(diǎn)是否為天然表達(dá)狀態(tài)，避免因錯(cuò)誤注釋或翻譯后修飾遺漏而導(dǎo)致的驗(yàn)證失敗。這對于抗體設(shè)計(jì)、合成肽藥物開發(fā)具有重要意義，是保障轉(zhuǎn)化效率的核心環(huán)節(jié)。

二、技術(shù)進(jìn)步加速肽測序價(jià)值釋放

隨著質(zhì)譜設(shè)備性能的持續(xù)提升，肽測序的通量、靈敏度與精度正在同步提升。當(dāng)前常用的HCD和EThcD碎裂模式已實(shí)現(xiàn)對復(fù)雜肽段的深度解析，結(jié)合AI算法優(yōu)化的譜圖匹配與序列預(yù)測，使得de novo測序結(jié)果更加穩(wěn)定可靠。同時(shí)，前處理策略的多樣化（如磷酸化肽富集、免疫親和捕獲、樣本級分級）和靶向質(zhì)譜方法的融合，顯著提升了對低豐度標(biāo)志物的檢測能力。這種從發(fā)現(xiàn)到驗(yàn)證的一體化流程，正在構(gòu)建標(biāo)志物研究的標(biāo)準(zhǔn)化路徑。

三、典型應(yīng)用場景中的實(shí)際意義

肽測序在多類疾病與生理狀態(tài)研究中均有廣泛應(yīng)用價(jià)值。例如，在腫瘤領(lǐng)域，可用于發(fā)現(xiàn)腫瘤特異性融合蛋白或突變肽段；在神經(jīng)系統(tǒng)疾病中，肽測序有助于識別腦脊液中tèyǒu的剪接異構(gòu)體；在感染和免疫研究中，能夠挖掘病原相關(guān)抗原肽，為疫苗和診斷靶點(diǎn)提供依據(jù)。此外，在藥物開發(fā)環(huán)節(jié)，肽測序還能監(jiān)測關(guān)鍵靶蛋白的修飾狀態(tài)變化，揭示作用機(jī)制并評估藥效，提升候選化合物的開發(fā)效率。

在jīngzhǔn醫(yī)學(xué)加速落地的當(dāng)下，生物標(biāo)志物不再局限于傳統(tǒng)“高表達(dá)”的篩選邏輯，而需要具備功能性、特異性和可驗(yàn)證性。肽測序通過提供序列層面和修飾層面的高分辨率信息，正在成為構(gòu)建高質(zhì)量標(biāo)志物體系的重要工具。未來，隨著算法持續(xù)優(yōu)化與質(zhì)譜設(shè)備升級，肽測序?qū)⑦M(jìn)一步拓寬其在臨床前研究、個(gè)體化診療、靶點(diǎn)驗(yàn)證等領(lǐng)域的應(yīng)用廣度。百泰派克生物科技依托高分辨率質(zhì)譜系統(tǒng)與成熟的dànbáizhì組學(xué)數(shù)據(jù)分析管線，能夠?yàn)殡臏y序提供定制化解決方案。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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