ABPP探針怎么設(shè)計？關(guān)鍵策略解析

ABPP探針怎么設(shè)計？關(guān)鍵策略解析檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

活性基蛋白zhìzǔxué（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）是一種以功能為導(dǎo)向的dànbáizhì組研究技術(shù)，能夠特異性捕獲細胞或組織中處于活性狀態(tài)的酶類蛋白。ABPP不僅能提供蛋白表達信息，還能反映其真實功能狀態(tài)，是酶類靶標發(fā)現(xiàn)、藥物作用機制解析、疾病標志物篩選的關(guān)鍵工具。ABPP的核心在于“探針設(shè)計”。一款優(yōu)質(zhì)的ABPP探針，必須具備良好的靶向性、反應(yīng)活性和信號可讀性。因此，一款功能性強、特異性高的ABPP探針該如何科學(xué)設(shè)計以及設(shè)計的關(guān)鍵策略的選定是ABPP研究的核心。

一、ABPP探針的基本組成結(jié)構(gòu)

一套標準的ABPP探針通常包括三個核心部分：

1、反應(yīng)基團（Reactive Warhead）：負責與靶蛋白活性位點共價結(jié)合

2、選擇性識別基（Recognition Element，可選）：增強探針的結(jié)構(gòu)選擇性

3、標簽基團（Tag, 如熒光基團、shēngwùsù）：用于信號檢測或后續(xù)富集

許多探針還會在標簽與活性基之間加入“連接臂”（Linker），以提高空間構(gòu)象靈活性，避免空間位阻影響標記效率

二、關(guān)鍵策略一：根據(jù)酶類特性選擇“活性基”

不同類型的酶對“反應(yīng)基團”的偏好差異顯著。選擇合適的warhead，是探針設(shè)計成功與否的dìyī步：

三、關(guān)鍵策略二：標簽類型與應(yīng)用場景匹配

不同的實驗需求決定了探針標簽的設(shè)計方向：

1、熒光標簽（如Cy5, FITC）：適用于活細胞成像、流式檢測

2、shēngwùsù標簽：利于后續(xù)與鏈霉親和素進行富集和質(zhì)譜分析

3、Click化學(xué)手柄（如炔基、疊氮）：通過CuAAC反應(yīng)連接多種標簽，靈活度高

4、同位素標簽（如重氮）：結(jié)合定量蛋白zhìzǔxué，實現(xiàn)ABPP-quant分析。

四、關(guān)鍵策略三：Linker設(shè)計影響探針整體性能

連接臂的作用常被低估，但實際對探針活性影響顯著。yōuxiù的Linker應(yīng)具備：

1、 化學(xué)穩(wěn)定性：避免在細胞環(huán)境中自我降解

2、足夠柔性：保證標簽不干擾warhead與酶位點結(jié)合

3、適宜長度：保證空間結(jié)構(gòu)合理，避免位阻效應(yīng)

常見Linker如PEG鏈、烷基鏈、肽鏈等，可根據(jù)應(yīng)用場景靈活選擇。

五、關(guān)鍵策略四：結(jié)構(gòu)優(yōu)化與非特異性結(jié)合控制

ABPP探針一大挑戰(zhàn)是非特異性背景高。應(yīng)通過以下策略優(yōu)化：

1、使用“結(jié)構(gòu)類似物”作為競爭抑制對照，提高特異性評估能力

2、設(shè)計探針空白對照（如不帶warhead的結(jié)構(gòu)）

3、引入可“cleavable tag”結(jié)構(gòu)，便于后續(xù)洗脫純化與jīngquè信號識別

百泰派克生物科技在ABPP服務(wù)中，基于靶酶性質(zhì)庫和反應(yīng)性數(shù)據(jù)庫，為客戶定制zuì優(yōu)活性基組合，實現(xiàn)高效、低背景的靶點捕獲。如果你正在尋找zhuānyè的ABPP探針開發(fā)與靶點篩選服務(wù)，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技，我們將以全流程平臺能力，為你的功能蛋白研究提供堅實支持。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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