Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在毒液蛋白分析

Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在毒液蛋白分析中的應(yīng)用場(chǎng)景與優(yōu)勢(shì)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

毒液是一種高度進(jìn)化的生化混合物，含有多種具有特異活性的蛋白和肽類分子。這些毒素在藥物開(kāi)發(fā)、靶點(diǎn)篩選和分子機(jī)制研究中具有重要應(yīng)用價(jià)值。然而，毒液蛋白普遍存在高度同源性、剪接變異和豐富的翻譯后修飾，使其難以被酶解-肽段級(jí)別分析方法全面解析。Top-Downdànbáizhì組學(xué)，作為直接分析完整dànbáizhì分子的策略，正在成為解決毒液蛋白異質(zhì)性和結(jié)構(gòu)完整性難題的關(guān)鍵技術(shù)。

一、什么是Top-Downdànbáizhì組學(xué)？

Top-Downdànbáizhì組學(xué)指直接以完整蛋白為分析對(duì)象，通過(guò)高分辨率質(zhì)譜實(shí)現(xiàn)蛋白序列、翻譯后修飾（PTMs）以及異構(gòu)體信息的全量獲取。其技術(shù)路徑通常包括：

• 蛋白級(jí)別的前體離子分離

• 高能或電子轉(zhuǎn)移誘導(dǎo)碎裂（ETD/EThcD）

• 蛋白級(jí)別的譜圖解讀與同位素分辨

相較于酶解策略，Top-Down能保留蛋白的原始結(jié)構(gòu)信息，尤其適合分析結(jié)構(gòu)高度復(fù)雜、功能調(diào)控依賴PTM的蛋白體系，如毒液蛋白。

二、毒液蛋白研究中的典型應(yīng)用場(chǎng)景

1、蛋白異構(gòu)體與剪接變體的jīngzhǔn識(shí)別

毒液中常見(jiàn)多個(gè)序列極為相近的蛋白亞型，如PLA2、金屬蛋白酶等。Top-Down能夠通過(guò)完整dànbáizhì量和特異性碎片，區(qū)分微小序列差異，實(shí)現(xiàn)異構(gòu)體級(jí)別的精細(xì)歸屬。

2、翻譯后修飾的原位定位

毒液蛋白常帶有糖基化、磷酸化、羥基化等修飾，這些修飾顯著影響毒素活性與靶標(biāo)識(shí)別。Top-Down通過(guò)保留完整蛋白結(jié)構(gòu)，實(shí)現(xiàn)修飾位點(diǎn)的直接識(shí)別和定性分析。

3、同源蛋白的去卷積與相對(duì)定量

毒液中多個(gè)高同源性蛋白家族易在肽段分析中出現(xiàn)共享肽混淆。Top-Down通過(guò)特異性全蛋白譜圖實(shí)現(xiàn)家族成員的去卷積，為jīngquè定量提供基礎(chǔ)。

4、新型毒素的發(fā)現(xiàn)與結(jié)構(gòu)注釋

針對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)中未記錄的新dànbáizhì種類，Top-Down可基于實(shí)驗(yàn)譜圖反向推導(dǎo)序列特征，輔助新毒素的結(jié)構(gòu)鑒定與功能初步注釋，拓展毒液蛋白組的未知空間。

三、技術(shù)優(yōu)勢(shì)：結(jié)構(gòu)信息完整，功能解讀更深

Top-Down提供的信息維度更為全面，尤其在研究多修飾、強(qiáng)同源蛋白時(shí)展現(xiàn)出明顯優(yōu)勢(shì)，極大提升毒液蛋白組的解析深度和生物學(xué)解釋力。

毒液蛋白作為高度進(jìn)化的功能性分子集合，蘊(yùn)含巨大的科學(xué)研究與轉(zhuǎn)化應(yīng)用潛力。Top-Downdànbáizhì組學(xué)通過(guò)提供dànbáizhì結(jié)構(gòu)與功能的完整視角，為揭示毒液復(fù)雜性及其生物學(xué)效應(yīng)提供了關(guān)鍵工具。隨著質(zhì)譜技術(shù)與算法模型的不斷進(jìn)步，其在天然毒素解析、功能研究及新藥物開(kāi)發(fā)中的應(yīng)用前景將更加廣闊。百泰派克生物科技圍繞Top-Downdànbáizhì組學(xué)構(gòu)建了系統(tǒng)化服務(wù)體系，無(wú)論是毒液蛋白的系統(tǒng)組學(xué)研究，還是特定毒素的功能驗(yàn)證，百泰派克生物科技均可提供高可靠性、高分辨率的全流程支持。如需獲取定制化Top-Down蛋白組學(xué)分析方案，歡迎聯(lián)系我們。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

Top-Down蛋白質(zhì)組學(xué)在毒液蛋白分析中的應(yīng)用場(chǎng)景與優(yōu)勢(shì)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹