它在生物學(xué)中的應(yīng)用范圍是有限的。當(dāng)用可見(jiàn)光觀察不透明的某些物體時(shí)，在較溉的紅外光區(qū)域就會(huì)變得透明，這種效應(yīng)已經(jīng)被用于研究在某些昆蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)的滲入黑色素的甲殼質(zhì)層。但是，某些有機(jī)物質(zhì)在2-30微米波長(zhǎng)范圍內(nèi)的吸收特性實(shí)際上并沒(méi)有應(yīng)用到生物學(xué)物質(zhì)的定性和定量的顯微研究中，除了儀器和像的記錄問(wèn)題而外，也由于在這種波長(zhǎng)范圍內(nèi)分辨力的損失已經(jīng)變得十分引人注目。一個(gè)數(shù)值孔徑為0.6物鏡的最小分辨距離大約與所使用的光線的波長(zhǎng)是相等的，這就意味著使用一個(gè)這樣孔徑的反射物鏡，以波長(zhǎng)為10μm的紅外光觀察一個(gè)直徑為10μm左右的細(xì)胞幾乎是不可能的。

 

　　測(cè)量方式：

　　紅外顯微鏡按其光路系統(tǒng)的差異，一般分為非同軸光路紅外顯微鏡和同軸光路紅外顯微鏡兩大類(lèi)。非同軸光路紅外顯微鏡是較早推出使用的一類(lèi)紅外顯微鏡，具有透射式和反射式兩種操作功能。同軸光路紅外顯微鏡是另一類(lèi)紅外顯微鏡，也具有透射式和反射式兩種操作模式。也可以采用衰減全反射模式，它采用的是硅晶體。

　　根據(jù)紅外顯微鏡所測(cè)樣品的形態(tài)、性質(zhì)和測(cè)試要求，可以選擇透射、反射、衰減全反射三種測(cè)試模式。透射模式是測(cè)定樣品的主要方法，可提供好的信噪比，適應(yīng)于測(cè)試透光性較好的樣品，如厚度小于20μm的薄膜、固體切片;

　　反射模式是效率較高的一種測(cè)試方法，適應(yīng)于測(cè)定背景比較光亮、光反射較強(qiáng)的樣品，如微小顆粒樣片;衰減全反射模式，在某些情況下是不可少的一種測(cè)量方法，適應(yīng)于測(cè)定需進(jìn)行表面成分或表面污染物分析的樣品。