微流控芯片通道 50–200 μm,曲率半徑 <5×通道高,用傳統(tǒng)四面體網(wǎng)格需 800 萬單元才能捕捉壁面梯度。 immersed boundary 法把笛卡爾網(wǎng)格套在 STL 上,網(wǎng)格量壓到 120 萬,筆記本 GPU 就能跑。先做網(wǎng)格無關(guān)性驗(yàn)證,把 y+ 降到 0.8,再?zèng)Q定買許可證,省下一臺(tái)工作站預(yù)算。
細(xì)胞培養(yǎng)液里帶 3% CO? 氣泡,直徑 20–60 μm。 VOF 界面銳化系數(shù) 0.5 時(shí),氣泡在 T 型路口后緣被數(shù)值抹平,導(dǎo)致壁面剪切力(WSS)假性升高 8%。 Level-Set 默認(rèn)重新初始化,界面厚度 1.5 網(wǎng)格,能把 WSS 誤差壓到 2%,許可證貴 15%,論文卻少一次返工。
模擬細(xì)胞貼壁,需要把受體–配體結(jié)合寫成自定義函數(shù)。 continuous film 把細(xì)胞當(dāng)液體薄膜,計(jì)算快但給不出單細(xì)胞軌跡。 discrete adhesion 用 DEM-LBM 耦合,一條通道 5000 顆粒,時(shí)間步 10?? s,一夜算 0.1 s 物理時(shí)間。確認(rèn)軟件支持 UDF 熱加載,再買多核并行授權(quán),否則顆粒數(shù)砍半,結(jié)果發(fā)不了高水平期刊。
通道長 10 mm,網(wǎng)格 500 萬,32 核并行效率 92%,64 核掉到 78%。廠商報(bào)價(jià)按核數(shù)階梯跳,32→64 核價(jià)差 1.2 萬 USD。跑基準(zhǔn)算例,把并行效率 80% 對(duì)應(yīng)的核數(shù)記下來,只買這個(gè)檔位,剩下預(yù)算留給內(nèi)存擴(kuò)容。
大渦模擬(LES)+ 顆粒追蹤,每個(gè)單元附加 48 字節(jié)粒子鏈表,500 萬單元把內(nèi)存拉到 240 GB。下單前用廠商自帶 benchmark 把模型跑通,看任務(wù)管理器峰值,再?zèng)Q定 256 GB 還是 512 GB。內(nèi)存買小,求解器被 OOM 殺掉,算一天的數(shù)據(jù)直接蒸發(fā)。
軟件安裝完先跑 2D lid-driven cavity Re=1000,把中心速度分量與 Ghia 1982 數(shù)據(jù)比對(duì),誤差小于0.01% 說明數(shù)值格式靠譜。誤差百分之零點(diǎn)一以上,后續(xù)微流控模擬再花哨也會(huì)被審稿人質(zhì)疑“算法本身不精"。這一步不過,直接退貨,省得后面扯皮。
微流控芯片原廠給 STL,三角面片 0.5 μm 一個(gè)節(jié)點(diǎn),導(dǎo)入 CFD 后曲面出現(xiàn)鋸齒,壁面剪切力噪聲 ±15%。用 STEP 格式,NURBS 曲面保留,導(dǎo)入后網(wǎng)格質(zhì)量 skewness <0.75,WSS 噪聲降到 ±3%。讓代工廠提供 STEP,價(jià)格比 STL 貴 200 元,一次付清,后端模擬省兩周修網(wǎng)格時(shí)間。
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