六種SNP分型技術(shù)全解析

SNP（單核苷酸多態(tài)性）作為最常見的遺傳變異類型，在疾病研究、藥物基因組學(xué)和進(jìn)化遺傳學(xué)等領(lǐng)域應(yīng)用廣泛。今天我們來盤點(diǎn)六種主流的SNP分型技術(shù)及其適用場景。

低通量精準(zhǔn)檢測

TaqMan探針法

· 原理：探針攜帶熒光基團(tuán)，水解后釋放熒光信號

· 優(yōu)勢：操作簡單，單樣本單點(diǎn)位快速檢測

· 適用：臨床單點(diǎn)位驗(yàn)證

等位基因特異性PCR

· 原理：引物3'端針對性匹配變異堿基，僅正確匹配時擴(kuò)增

· 優(yōu)勢：設(shè)計(jì)簡單、成本低

· 適用：低頻位點(diǎn)快速篩查

PCR-RFLP技術(shù)

· 原理：PCR擴(kuò)增后酶切，電泳分離片段

· 優(yōu)勢：成本極低，無需特殊設(shè)備 ，適用于已知酶切位點(diǎn)變異

· 適用：低頻位點(diǎn)初篩

中高通量應(yīng)用

LDR連接酶檢測法

· 原理：多重PCR擴(kuò)增后連接酶區(qū)分SNP，毛細(xì)管電泳

· 優(yōu)勢：中通量（20+位點(diǎn)/管），靈敏度高，準(zhǔn)確率高

· 適用：藥物基因組學(xué)研究

高通量解決方案

基因芯片

· 原理：樣本DNA與固定探針雜交后熒光掃描

· 優(yōu)勢：超高通量（百萬級位點(diǎn)），全基因組覆蓋

· 適用：人群GWAS研究、遺傳病篩查

高通量測序

· 原理：對捕獲區(qū)域深度測序，比對識別SNP

· 優(yōu)勢：檢測所有變異類型，支持新變異發(fā)現(xiàn)

· 適用：群體進(jìn)化研究

每種技術(shù)各有千秋，研究人員可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求、通量要求和預(yù)算條件選擇適合的方案。