如何選擇合適的蛋白質(zhì)測序技術(shù)？

如何選擇合適的蛋白質(zhì)測序技術(shù)？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

dànbáizhì測序是研究dànbáizhì結(jié)構(gòu)與功能的核心技術(shù)，廣泛應(yīng)用于靶點發(fā)現(xiàn)、機制解析、生物標志物篩選、抗體表征等生物醫(yī)學(xué)研究和藥物開發(fā)領(lǐng)域。然而，隨著質(zhì)譜技術(shù)和化學(xué)測序手段的不斷發(fā)展，市面上可選的dànbáizhì測序技術(shù)越來越多，不同技術(shù)的適用場景、分辨率、成本和通量也有所差異。那么，面對眾多測序方案，科研人員應(yīng)如何科學(xué)選擇zuì適合的dànbáizhì測序技術(shù)？本文將從技術(shù)原理、核心優(yōu)勢、典型應(yīng)用和選擇建議四個方面進行系統(tǒng)解析，助力您做出高效決策。

一、dànbáizhì測序技術(shù)的主流類型

dànbáizhì測序主要分為兩大類：基于質(zhì)譜的分析型測序（Bottom-up / Top-down） 和基于Edman降解的化學(xué)測序，以及新興的單分子測序方法。目前常用的包括：

1、Bottom-up dànbáizhì質(zhì)譜測序（肽段級）

（1）原理：將dànbáizhì酶解為肽段，通過LC-MS/MS分析肽段序列

（2）優(yōu)點：高通量、高靈敏度、適用于復(fù)雜樣本

（3）限制：肽段映射存在不wánquán覆蓋風(fēng)險，PTM信息可能丟失

2、Top-down dànbáizhì測序（全長級）

（1）原理：對完整蛋白進行質(zhì)譜裂解，直接讀取片段結(jié)構(gòu)

（2）優(yōu)點：可保留修飾信息，適用于單一蛋白、蛋白異構(gòu)體解析

（3）限制：對蛋白純度和質(zhì)譜分辨率要求jígāo

3、Edman降解（經(jīng)典化學(xué)測序）

（1）原理：氨基末端逐個循環(huán)切除并鑒定氨基酸殘基

（2）優(yōu)點：序列準確率高，適合小分子肽段

（3）限制：序列長度有限，一般不超過30個氨基酸；對N端封閉蛋白無效

4、單分子dànbáizhì測序（正在發(fā)展中）

（1）原理：通過納米孔、熒光或光學(xué)方法直接讀取單分子氨基酸序列

（2）優(yōu)點：理論上可實現(xiàn)單細胞分辨率

（3）限制：仍處于研發(fā)或早期商業(yè)化階段，成本高、精度待優(yōu)化

二、不同應(yīng)用場景下的dànbáizhì測序技術(shù)推薦

根據(jù)研究目標的不同，dànbáizhì測序技術(shù)的選擇也應(yīng)有所側(cè)重。以下是常見科研或藥物開發(fā)場景下的推薦策略：

1、抗體表征與確認序列

（1）推薦技術(shù)：Top-down質(zhì)譜 或Edman降解結(jié)合質(zhì)譜

（2）原因：需要識別抗體的可變區(qū)（CDR）序列和輕重鏈組合，且要求序列準確性高

（3）百泰派克解決方案：支持原液抗體、雜交瘤上清或純化產(chǎn)物的抗體全序列分析，結(jié)合酶切優(yōu)化與高分辨Orbitrap測序，準確度>98%

2、新蛋白/未知蛋白的初步鑒定

（1）推薦技術(shù)：Bottom-up質(zhì)譜測序（de novo + database search）

（2）原因：無需已知序列，適合物種數(shù)據(jù)庫缺乏或全新蛋白探索

（3）百泰派克支持：搭建多酶酶解 + 多段母離子篩選 + 數(shù)據(jù)庫+反向數(shù)據(jù)庫的混合算法，提升未知蛋白識別能力

3、蛋白翻譯后修飾（PTM）位點測序

（1）推薦技術(shù)：Bottom-up + ETD/HCD串聯(lián)質(zhì)譜

（2）原因：需解析磷酸化、乙?；⑻腔刃揎椢稽c的jīngquè位置

（3）百泰派克優(yōu)勢：支持多種PTM富集策略，配合二級碎裂優(yōu)化策略提高鑒定覆蓋率

4、蛋白藥一致性/穩(wěn)定性研究

（1）推薦技術(shù)：Top-down測序 + 高分辨同分異構(gòu)體解析

（2）原因：可用于批次一致性驗證、突變體鑒定、降解產(chǎn)物分析

（3）百泰派克平臺：具備 >240,000分辨率的Orbitrap Eclipse系統(tǒng)，可實現(xiàn)蛋白異構(gòu)體水平解析

三、技術(shù)選型建議：如何快速做出決策？

在選擇dànbáizhì測序技術(shù)時，可重點參考以下5個維度：

如果無法明確判斷，建議選擇具備多平臺、多技術(shù)整合能力的第三方機構(gòu)，如百泰派克生物科技，進行項目評估與策略設(shè)計。

百泰派克生物科技的dànbáizhì測序服務(wù)特色

百泰派克生物科技構(gòu)建了完整的dànbáizhì測序平臺，覆蓋從低通量到高通量、從標準酶解到gāojí修飾識別的全流程技術(shù)能力：

* 高分辨質(zhì)譜平臺：Orbitrap Eclipse、timsTOF Pro 2

• 多重酶解策略：Trypsin、Glu-C、Chymotrypsin 等組合

• 高置信序列重建算法：支持 de novo + 數(shù)據(jù)庫混合建庫

• 抗體測序?qū)＞€服務(wù)：支持雜交瘤細胞、原液抗體、表達產(chǎn)物全流程表征

• 專家級數(shù)據(jù)解讀報告：涵蓋序列圖譜、置信評分、比對結(jié)果、可視化圖例

我們致力于為高校科研團隊、生物醫(yī)藥企業(yè)提供個性化、一站式的dànbáizhì測序解決方案。無論是探索性發(fā)現(xiàn)，還是產(chǎn)品級一致性分析，我們都能助您高效推進科研與開發(fā)進程。

dànbáizhì測序技術(shù)正以qiánsuǒwèiyǒu的速度革新，并不斷拓展其在jīngzhǔn醫(yī)學(xué)、抗體藥物開發(fā)和基礎(chǔ)研究中的應(yīng)用邊界。選擇合適的技術(shù)方案，不僅影響數(shù)據(jù)質(zhì)量，也直接關(guān)系到項目進展速度和研究深度。如果您正面臨技術(shù)選型難題，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技的項目經(jīng)理，我們將為您提供免費的技術(shù)評估建議與項目設(shè)計支持，讓您的每一次測序投資更具價值。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

如何選擇合適的蛋白質(zhì)測序技術(shù)？檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹