高通量基因敲除技術(shù)藥物篩選和靶點(diǎn)鑒定

高通量基因敲除技術(shù)藥物篩選和靶點(diǎn)鑒定檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

藥物發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵步驟是靶點(diǎn)識別——即發(fā)現(xiàn)“可成藥”的生物靶點(diǎn)，在確定靶點(diǎn)后，還必須對其進(jìn)行驗(yàn)證以證明靶點(diǎn)與疾病表型之間的功能關(guān)系，同時(shí)確保安全性。藥物發(fā)現(xiàn)的過程漫長且昂貴，但良好的靶點(diǎn)驗(yàn)證將提高開發(fā)有效藥物并zuì終在臨床取得成功的可能性。CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)的zuì新發(fā)展對藥物發(fā)現(xiàn)產(chǎn)生了巨大影響，研究人員能夠有意激活或抑制基因，以闡明和了解那些在疾病進(jìn)展中發(fā)揮作用的細(xì)胞途徑。它還可用于創(chuàng)建準(zhǔn)確的模型，以更好地研究疾病表型并篩選小分子以快速識別眾多潛在目標(biāo)。

一旦識別出這些潛在的靶點(diǎn)，就可以利用質(zhì)譜技術(shù)來研究潛在藥物分子與其靶標(biāo)dànbáizhì或代謝產(chǎn)物之間的相互作用，揭示藥物如何與其靶點(diǎn)結(jié)合，以及這種結(jié)合如何影響細(xì)胞內(nèi)的信號傳遞和代謝途徑。通過結(jié)合高通量基因敲除技術(shù)和質(zhì)譜分析，研究人員不僅可以快速地識別新的藥物靶點(diǎn)，還能深入理解藥物的作用機(jī)制，從而設(shè)計(jì)出更有效、更安全的治療方法。

高通量基因敲除在藥物發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用

百泰派克生物科技（BTP）基于高通量基因敲除技術(shù)，結(jié)合高通量質(zhì)譜平臺，可以為您提供從基因敲除到藥物靶點(diǎn)鑒定的一站式解決方案。我們優(yōu)化的CRISPR/Cas9系統(tǒng)可實(shí)現(xiàn)人/小鼠細(xì)胞系、原代細(xì)胞、免疫細(xì)胞及iPS細(xì)胞的單/多基因敲除、移碼突變和大序列敲除。BTP自建7大檢測平臺，擁有CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證實(shí)驗(yàn)室，旨在為您提供zuì優(yōu)質(zhì)的科研服務(wù)，我們期待與您的合作，歡迎免費(fèi)聯(lián)系我們，了解更多服務(wù)詳情！

服務(wù)優(yōu)勢

1）敲除效率保證：優(yōu)化的CRISPR/Cas9系統(tǒng)，超過80%靶點(diǎn)敲除效率在70%；基因敲除后，我們采用Sanger測序和深度dànbáizhì組學(xué)技術(shù)對敲除效率進(jìn)行雙驗(yàn)證，雙重保障數(shù)據(jù)的真實(shí)性。

2）多種基于靶標(biāo)的藥物靶點(diǎn)鑒定平臺：我們依托高分辨質(zhì)譜平臺，結(jié)合親和層析技術(shù)以及活性位點(diǎn)定向探針等技術(shù)，開發(fā)并驗(yàn)證了多種基于靶標(biāo)的藥物靶點(diǎn)鑒定平臺，可滿足不同的科研需求。

3）項(xiàng)目周期短：在進(jìn)行基因敲除實(shí)驗(yàn)前，我們會(huì)對不同細(xì)胞中基因必要性及表達(dá)量進(jìn)行分析，確保實(shí)驗(yàn)的可行性，降低實(shí)驗(yàn)失敗風(fēng)險(xiǎn)；且無需針對客戶的靶點(diǎn)設(shè)計(jì)預(yù)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行g(shù)RNA驗(yàn)證，大大縮短了項(xiàng)目周期。

4）一站式服務(wù)：BTP擁有豐富的組學(xué)服務(wù)經(jīng)驗(yàn)以及zhuānyè的技術(shù)人員，可以根據(jù)您的需求定制zuì優(yōu)的項(xiàng)目方案，您只需將您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康母嬖V我們并寄送樣品，BTP負(fù)責(zé)所有項(xiàng)目后續(xù)，包括樣品處理、實(shí)驗(yàn)分析、數(shù)據(jù)分析和項(xiàng)目報(bào)告。

應(yīng)用案例

1.全基因組 CRISPR-cas9 敲除篩選結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)確定 KRAS 突變結(jié)腸癌 MEK 抑制劑耐藥性靶點(diǎn)

靶向 KRAS 通路是治療結(jié)直腸癌（CRC）非常有前景的方法，但結(jié)直腸癌細(xì)胞能夠耐受 MEK 抑制劑，使得 MEK 抑制劑在 CRC 患者中的臨床試驗(yàn)結(jié)果不盡人意。因此，作者 在 MEK 抑制劑存在的情況下進(jìn)行全基因組 CRISPR/Cas9 篩選，以鑒定在含有 KRAS 突變的 CRC 模型中通過 MEK 抑制而綜合致死的基因。結(jié)果表明，GRB7 通過 RTK 途徑使 CRC 細(xì)胞對 MEK 抑制劑產(chǎn)生主要耐藥性。 GRB7 免疫沉淀物的質(zhì)譜分析表明 PLK1 是 GRB7 的主要相互作用激酶。PLK1 和 MEK 抑制劑的組合在體外和體內(nèi)協(xié)同抑制 CRC 細(xì)胞增殖并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。zuì終，作者確定 GRB7-PLK1 是介導(dǎo) RTK 的樞軸，導(dǎo)致 MEK 抑制劑耐受。該研究表明，在攜帶 KRAS 突變的 CRC 患者的臨床治療中，PLK1 是協(xié)同 MEK 抑制劑的一個(gè)有前景的靶點(diǎn)。

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圖1. CRISPR 文庫篩選，確定 RTK 通路參與 KRAS 突變結(jié)腸癌細(xì)胞的 MEK抑制劑耐藥性

2.利用 CRISPR 高通量篩選下一代候選藥物

jífēitìní和厄洛替尼是治療非小細(xì)胞肺癌的有效藥物，它們以表皮生長因子受體（EGFR）為治療靶點(diǎn)，但是 EGFR 的獲得性突變 C797S 阻止藥物與 EGFR làoānsuān激酶結(jié)構(gòu)域靶位點(diǎn)相互作用，使患者對這些藥物治療表現(xiàn)出耐藥性。阿斯利康（Astra Zeneca）使用CRISPR-Cas9高通量基因敲除技術(shù)在癌細(xì)胞系中創(chuàng)建了jīngquè的 C797S 突變， C797S 細(xì)胞系模型的應(yīng)用使藥物篩選能夠識別針對這種新突變的下一代化合物。

Thress, K., et al. Nat Med.

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圖2. 獲得性EGFR C797S突變介導(dǎo)的AZD9291獲得性耐藥性

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)先進(jìn)，填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

高通量基因敲除技術(shù)藥物篩選和靶點(diǎn)鑒定檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹