基于iTRAQ的肽組學(xué)技術(shù)在炎癥研究中的

基于iTRAQ的肽組學(xué)技術(shù)在炎癥研究中的應(yīng)用檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

iTRAQ同位素標(biāo)記技術(shù)，可對(duì)樣本中的肽段 N 端與賴氨酸側(cè)鏈進(jìn)行共價(jià)標(biāo)記，通過 4-plex 或 8-plex 多重標(biāo)記，實(shí)現(xiàn)多樣品同時(shí)定量。在質(zhì)譜二級(jí)圖譜（MS/MS）中，這些同質(zhì)異構(gòu)的標(biāo)簽裂解產(chǎn)生特征 reporter 離子，可用于jīngquè比較不同處理組的肽豐度?；?iTRAQ 技術(shù)的肽組學(xué)在炎癥研究中應(yīng)用廣泛，涵蓋機(jī)制探索、藥物反應(yīng)監(jiān)測(cè)與生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)，結(jié)合 PRM/ELISA 可實(shí)現(xiàn)科研與臨床的有效對(duì)接。

一、基于iTRAQ的肽組學(xué)技術(shù)為何適用于炎癥研究？

1、高通量比較能力：多樣本可在單次 LC-MS/MS 中同時(shí)分析，減少實(shí)驗(yàn)偏差；

2、靈敏度與定量重現(xiàn)性高：相比標(biāo)簽前方法，iTRAQ 可同時(shí)兼具定性與半定量能力；

3、對(duì)炎癥標(biāo)志物探測(cè)高效：炎癥反應(yīng)中，細(xì)胞因子、補(bǔ)體、炎癥相關(guān)酶和受體等成分動(dòng)態(tài)變化顯著，iTRAQ 可捕捉這些低豐度變化。

二、基于iTRAQ的肽組學(xué)技術(shù)在炎癥研究中的應(yīng)用

炎癥作為機(jī)體對(duì)感染、損傷或免疫刺激的高度復(fù)雜反應(yīng)過程，涉及大量可溶性因子（如細(xì)胞因子、趨化因子、補(bǔ)體蛋白）、受體和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的動(dòng)態(tài)調(diào)控。傳統(tǒng)手段難以全面捕捉這些多維動(dòng)態(tài)變化，而 iTRAQ 技術(shù)結(jié)合高分辨質(zhì)譜，為炎癥過程的系統(tǒng)性研究提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支持。

1、揭示炎癥介質(zhì)的表達(dá)變化

通過對(duì)不同處理組肽段進(jìn)行等摩爾標(biāo)記，在一次 LC-MS/MS 分析中實(shí)現(xiàn)多樣本平行定量，大幅提升了通量和比較效率。在炎癥研究中，該技術(shù)可廣泛應(yīng)用于分析以下炎癥相關(guān)因子：基于iTRAQ的肽組學(xué)技術(shù)

（1）急性期蛋白（如 C-反應(yīng)蛋白、血清淀粉樣蛋白等）：其表達(dá)動(dòng)態(tài)變化可被jīngquè量化，用于判斷炎癥程度。

（2）細(xì)胞因子調(diào)控蛋白：包括IL-1/6調(diào)節(jié)因子、NF-κB信號(hào)調(diào)控因子、STAT相關(guān)通路蛋白等，可揭示免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)異常機(jī)制。

（3）細(xì)胞凋亡與自噬相關(guān)因子：炎癥狀態(tài)下細(xì)胞命運(yùn)變化的重要調(diào)節(jié)蛋白（如 caspase、Beclin-1）也可通過 iTRAQ 分析其豐度變化。

2、炎癥通路富集與網(wǎng)絡(luò)建模

通過 iTRAQ 數(shù)據(jù)結(jié)合生物信息學(xué)分析，可識(shí)別在炎癥狀態(tài)下顯著上調(diào)或下調(diào)的多肽，并進(jìn)一步進(jìn)行功能注釋與通路富集（如 KEGG/GO 分析）：

（1）識(shí)別激活通路：如 TNF-α/NF-κB、JAK/STAT、MAPK、NLRP3 炎癥小體等關(guān)鍵炎癥反應(yīng)通路。

（2）調(diào)控模塊重構(gòu)：通過蛋白互作網(wǎng)絡(luò)（PPI）分析構(gòu)建炎癥調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，挖掘關(guān)鍵 hub 蛋白。

（3）靶點(diǎn)預(yù)篩：依據(jù)表達(dá)趨勢(shì)與網(wǎng)絡(luò)中心度，鎖定潛在治療干預(yù)靶點(diǎn)。

3、疾病狀態(tài)分型與分期

iTRAQ 肽組學(xué)還可用于炎癥性疾病的分型研究，例如：

（1）輕度與重度炎癥對(duì)比：通過定量差異分析，找出病程早期與進(jìn)展期關(guān)鍵表達(dá)變化分子；

（2）治療響應(yīng)預(yù)測(cè)：基于 iTRAQ 數(shù)據(jù)構(gòu)建生物標(biāo)志物組合，預(yù)測(cè)個(gè)體對(duì)抗炎藥物、免疫抑制劑等療效；

（3）慢性與急性炎癥鑒別：識(shí)別特異分子模式（molecular signature），用于疾病類型分類或分期參考。

4、聯(lián)合多組學(xué)揭示炎癥網(wǎng)絡(luò)

在當(dāng)前精密醫(yī)學(xué)趨勢(shì)下，iTRAQ 肽組學(xué)常與其他組學(xué)數(shù)據(jù)（如轉(zhuǎn)錄組、代謝組、磷酸化組等）聯(lián)合分析：

（1）蛋白–mRNA 協(xié)同表達(dá)分析：判定蛋白豐度變化是否由轉(zhuǎn)錄水平驅(qū)動(dòng)，篩選轉(zhuǎn)錄后調(diào)控目標(biāo)；

（2）蛋白–代謝通路聯(lián)動(dòng)：揭示炎癥狀態(tài)下的能量代謝重編程（如乳酸代謝、脂肪酸氧化）；

（3）與表觀修飾組協(xié)同：結(jié)合乙?；?磷酸化組學(xué)，闡明炎癥信號(hào)傳導(dǎo)蛋白的修飾調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

5、炎癥標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)與轉(zhuǎn)化應(yīng)用

通過 iTRAQ 篩選出的差異表達(dá)多肽，可進(jìn)一步通過靶向質(zhì)譜（如 PRM/MRM）或免疫學(xué)手段（如 ELISA）進(jìn)行驗(yàn)證，推動(dòng)以下轉(zhuǎn)化應(yīng)用：

（1）炎癥診斷標(biāo)志物開發(fā)：挖掘可用于血液、尿液等樣本中檢測(cè)的非侵入性炎癥生物標(biāo)志物；

（2）個(gè)體化治療靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)：識(shí)別疾病亞群的特異性調(diào)控因子，指導(dǎo)靶向治療；

（3）藥效學(xué)評(píng)價(jià)指標(biāo)建立：作為藥物作用機(jī)制確認(rèn)與療效監(jiān)測(cè)的可靠定量指標(biāo)。

三、基于iTRAQ的肽組學(xué)技術(shù)實(shí)驗(yàn)流程詳解

1、樣本處理：提取血清、組織或細(xì)胞裂解液。

2、蛋白酶解：使用yídànbáiméi消化，生成可標(biāo)記肽段。

3、iTRAQ 標(biāo)記：分別將不同處理組肽段用各通道標(biāo)簽標(biāo)記，如 113–118。

4、樣本混合與預(yù)分離：混樣后通過 HILIC 或 SCX 分級(jí)，減少樣本復(fù)雜度。

5、LC-MS/MS 檢測(cè)：選用高分辨 Orbitrap 聯(lián)盟 MS 進(jìn)行多輪數(shù)據(jù)收集。

6、數(shù)據(jù)分析：利用 Mascot、MaxQuant 等平臺(tái)進(jìn)行賴氨酸肽識(shí)別與 reporter 離子峰定量。

7、差異蛋白篩選：選取 fold change ≥1.2 或 ≤0.83，結(jié)合 P 值和 FDR 校正。

8、通路富集分析：應(yīng)用 GO 與 KEGG 注釋解析炎癥相關(guān)通路。

9、靶向驗(yàn)證：使用 PRM 或 ELISA 對(duì)關(guān)鍵炎癥蛋白進(jìn)行驗(yàn)證與二次鑒定。

百泰派克生物科技助力炎癥研究

百泰派克生物科技擁有完善的 iTRAQ 標(biāo)記與 LC-MS/MS 平臺(tái)能力：高通量方案，適應(yīng)多樣本對(duì)比；豐富數(shù)據(jù)處理與生信分析經(jīng)驗(yàn)，提供通路富集與靶點(diǎn)挖掘報(bào)告；提供驗(yàn)證性 PRM/ELISA 服務(wù)，支撐臨床轉(zhuǎn)化；完整 QC 流程，符合 GLP/GCLP 標(biāo)準(zhǔn)，確保臨床級(jí)數(shù)據(jù)質(zhì)量。

基于iTRAQ的肽組學(xué)技術(shù)在炎癥研究中應(yīng)用廣泛，涵蓋機(jī)制探索、藥物反應(yīng)監(jiān)測(cè)與生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)，結(jié)合 PRM/ELISA 可實(shí)現(xiàn)科研與臨床的有效對(duì)接。百泰派克生物科技憑借成熟平臺(tái)和zhuānyè團(tuán)隊(duì)，可為客戶提供 iTRAQ 全流程解決方案，助力精密炎癥分析、標(biāo)志物開發(fā)與診斷轉(zhuǎn)化。如果您有炎癥相關(guān)研究需求，歡迎聯(lián)系我們，共同推動(dòng)炎癥科研與臨床應(yīng)用創(chuàng)新。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)*，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

基于iTRAQ的肽組學(xué)技術(shù)在炎癥研究中的應(yīng)用檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹