體電鏡vEM技術(shù)近年因《Nature》的點(diǎn)名備受關(guān)注,因其正重新定義生命科學(xué)研究的尺度邊界。傳統(tǒng)電子顯微鏡雖具備納米級分辨率,但數(shù)據(jù)多為二維結(jié)構(gòu)。vEM通過連續(xù)片層掃描與三維重構(gòu)算法的結(jié)合,實(shí)現(xiàn)了對生物樣本從亞細(xì)胞級到組織級的跨尺度成像。
針對本課題,本次網(wǎng)絡(luò)研討會,賽默飛邀請來自廣州醫(yī)科大學(xué)的陳浩教授,分享其研究利用體電鏡技術(shù)(volume electron microscopy, vEM),在哺乳動物附睪上皮細(xì)胞和小腸上皮細(xì)胞間發(fā)現(xiàn)并命名了一種新型細(xì)胞器儲存結(jié)構(gòu)—細(xì)胞間細(xì)胞器儲存庫(Intercellular Organelle Reservoirs, IORs),揭示了其在細(xì)胞器周轉(zhuǎn)和回收過程中的重要作用。
會議內(nèi)容干貨十足,現(xiàn)場討論也非常熱烈,特此加推回顧篇,可以給到遺憾未能參加現(xiàn)在直播研討會的學(xué)者們回顧會議內(nèi)容的機(jī)會。
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Q&A集錦
1個細(xì)胞10um,老師的數(shù)據(jù)組織塊是11um,13um左右,所以是想盡量還原單層細(xì)胞,然后進(jìn)行重構(gòu)?是不是理解成控制在單層細(xì)胞水平進(jìn)行重構(gòu)?
是的,主要是控制在單層細(xì)胞進(jìn)行重構(gòu)。10um便能看到一個相對完整的細(xì)胞。
好奇是如何具體定義IOR中各種結(jié)構(gòu)的,電鏡上主要通過形態(tài)嘛?
是的,在電鏡的成像上能非常清楚的看到各個細(xì)胞細(xì)胞器的形態(tài)。比如能很清楚的看到蛋白聚集體,溶酶體,像自噬小體也能能清楚辨認(rèn)的。
這個IOR區(qū)域,在精子成熟過程中,有沒有實(shí)質(zhì)性作用?
推測是有作用的。IOR分布在三維結(jié)構(gòu)側(cè)面,本身的結(jié)構(gòu)對精子應(yīng)該不是直接影響,推測會間接影響。我們目前在Rab27a小鼠上發(fā)現(xiàn),如果沒有Rab27a,會發(fā)現(xiàn)側(cè)面IOR泡狀結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)減少,精子活力下降,生育力也降低。故此說明IOR泡狀結(jié)構(gòu)會影響上皮細(xì)胞功能,最后影響到管腔里面精子的功能。
IOR的外圍是膜結(jié)構(gòu),在體電鏡觀察中,有沒有觀察到它與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-質(zhì)膜,存在接觸位點(diǎn),或者膜通道?
IOR外圍的膜,是生物自己的細(xì)胞膜。我們在體電鏡的結(jié)果下觀測到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)確實(shí)和細(xì)胞膜,以及線粒體有一定交互。但是由于試驗(yàn)過程中沒有很好的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)marker去標(biāo)示,所以在本次結(jié)果中,我們沒有將它標(biāo)記出來。
請問是否有desmosomes deficiency小鼠,這些小鼠不能形成IOR嗎?
我們沒有嘗試desmosome小鼠,但是猜測可能需要做條件敲除?因?yàn)閐esmosome在胚胎發(fā)育過程中很重要,初步猜測如果desmosome形成不了的話,這個IOR區(qū)域可能是沒有的。在我們的研究中,IS段的IOR,可見形態(tài)有別于其他附睪區(qū)段,呈現(xiàn)長泡狀或者管段狀。猜測是由于IS里的desmosome分布和表達(dá)很少,后面幾個區(qū)段的desmosome分布和表達(dá)較多的緣故。
請問老師這個研究中整體實(shí)驗(yàn)工作流程您覺得最困難的是樣品制備或是電鏡成像和后續(xù)分析?
在本次實(shí)驗(yàn)中,最限速的步驟是重構(gòu)這一步,因?yàn)樵谧鲞@個研究的時候,還沒有AI輔助的功能,只能依靠學(xué)生手動挑選。特別是針對細(xì)胞膜的重構(gòu),即便現(xiàn)在有了AI輔助,但是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜對細(xì)胞膜在重構(gòu)上的影響很大,相對困難。樣品制備不難,數(shù)據(jù)收集需要一定技巧,也不難。其實(shí)是很多時間花在后期數(shù)據(jù)重構(gòu)上。
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