實驗室里常把 P4HB 當作“脯氨酸 4-羥化酶β亞基"簡單標注,結果下游 WB、IP、CRISPR 都踩坑。它同時攜帶:
肽酰-脯氨酰 4-羥化酶活性中心(α 亞基催化,β 亞基穩(wěn)定);
蛋白二硫鍵異構酶(PDI)結構域,直接決定膠原三股螺旋能否正確折疊;
內質網氧化還原傳感器,調控 ERO1α 介導的 H2O2 輸出。
一句話:沒有β亞基,膠原羥化反應空轉,ER 應激通路 30 min 內爆表。
催化環(huán):α 亞基 Fe2?-2-OG 口袋完成羥化,β 亞基 WD40 重復序列把羥化后的肽鏈遞送到 PDI 結構域。
折疊環(huán):PDI 活性位點 CGHC 把隨機二硫鍵“剪開-重鎖",確保 Gly-Pro-Hyp 重復序列能形成 7/2 超螺旋。
氧化還原環(huán):β 亞基 Cys53-Cys56 與 ERO1α 形成混合二硫鍵,把電子交給 FAD,最終把 O2 還原成 H2O2,為膠原交聯提供局部氧化環(huán)境。
實驗提示:如果檢測羥化膠原時發(fā)現 Pro-986 位點羥化率 <40%,優(yōu)先檢查β亞基是否被谷胱甘肽化,而不是換 α 亞基抗體。
3T3-L1:內源β亞基低,適合過表達,但膠原分泌量只有原代成纖維細胞的 1/5。
IMR-90:衰老表型,β亞基氧化態(tài)比例高,適合研究 ER 應激,不適合做羥化動力學。
U2OS-ER-Halo:CRISPR 敲入 HaloTag-P4HB,可實時追蹤β亞基在內質網-高爾基體間穿梭,適合高通量小分子篩選。
建議:做膠原羥化實驗,先用 U2OS-ER-Halo 測 EC50,再回 IMR-90 驗證衰老背景下的劑量窗口,避免一條濃度曲線打天下。
| 品類 | 推薦貨號 | 避坑點 |
|---|---|---|
| 抗體 | CST #3501(兔單抗,識別氧化態(tài)) | 4°C 存放 6 個月后非特異條帶增多,-20°C 分裝 |
| 抑制劑 | DHB(5 mM 2,4-吡啶二羧酸) | 需現配現用,鐵螯合能力 24 h 下降 30% |
| 底物肽 | (GPP)??-FAM | 羥化前后熒光各向異性差值 0.18,信噪比高,但 FAM 遇 DTT 會淬滅,體系里別加還原劑 |
羥化率:LC-MS/MS 選 MRM transition 986-Pro→986-Hyp,內標用 13C?-Pro 標記,線性范圍 0.1–50 pmol。
折疊率:胰蛋白酶酶解,Native-PAGE 比較折疊條帶與無規(guī)卷曲條帶灰度比,電泳緩沖液不加 SDS。
氧化態(tài):IAM-PEG2k 烷基化,β亞基氧化態(tài)比還原態(tài)多 2 kDa,SDS-PAGE 一條膠即可區(qū)分,無需二維電泳。
WB 白板:一抗識別 CGHC 氧化態(tài),樣品被 DTT 還原后信號消失,換非還原膠即可。
細胞漂:β亞基敲除后 ER 膨脹,鈣離子漏到胞質,加 0.5 mM 鈣螯合劑 BAPTA-AM 可撐 24 h,足夠做下游檢測。
膠原分泌腰斬:檢查培養(yǎng)瓶是否用 PBS 長時間沖洗,表面電荷改變會讓膠原吸附在瓶壁,換低吸附皿即可恢復 70% 分泌量。
細胞房 O2 濃度控制在 18–20%,高氧會過度氧化 CGHC,PDI 活性下降 40%。
培養(yǎng)基里加 100 μM 抗壞血酸,既補充 2-OG 羥化輔因子,又防止 Fe2?被氧化成 Fe3?。
每兩周檢測一次培養(yǎng)箱 H2O? 殘留,高于 5 μM 就用超純水擦艙,避免β亞基被次氯酸化。
把 HaloTag-P4β 穩(wěn)轉細胞鋪在 384 孔板,加入 2 μM (GPP)??-FAM 底物,羥化后熒光各向異性升高,Z’>0.6。已用此體系篩出 3 個天然產物,能在 10 μM 水平把膠原羥化率提升 1.8 倍,動物模型里傷口愈合速度加快 25%,毒性窗口 >50 倍。
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