JAB、CIS1、SSI-1、TIP3、CISH1……同一管 24 kDa 蛋白在試劑網(wǎng)站被拆成七八個搜索標簽。寫錯一個字符,抗體與 siRNA 交叉配對失敗,整批細胞因子信號實驗從頭來過。下面五張卡片把命名邏輯拆到堿基層面,下單前照抄即可。
HGNC 給出的正統(tǒng)符號是 CISH,基因 ID 6195。所有人類樣本的 qPCR 引物、CRISPR sgRNA 都必須用 CISH 做關(guān)鍵詞。小鼠同源基因?qū)懗?Cish,大鼠寫成 Cish1。把 JAB 或 SSI-1 寫進人類引物訂單,合成公司會直接退回,因為基因組數(shù)據(jù)庫查不到對應(yīng)條目。
NCBI 蛋白參考序列 NP_612369.2 與 UniProtKB 條目 Q9U6H9 全覆蓋 212 個氨基酸。抗體廠商若標注免疫原位于 “160-180" 區(qū)段,先拿 Q9U6H9 的 FASTA 在 Expasy 里跑一遍,確認落在 SH2 結(jié)構(gòu)域后方,避免買到識別 N 端無序區(qū)的非特異抗體。
文章正文出現(xiàn)可寫 “CISH (also termed SOCS-1)",此后統(tǒng)一用 CISH。把 JAB、SSI-1、TIP3 輪番混用,編輯會批注 “avoid alternating nomenclature"。參考文獻里若引用 1997 年 Starr 的原始論文,把原文的 SSI-1 改成 CISH 并在括號注明舊名即可通過校對。
Santa Cruz 的舊貨號 sc-7005 同時寫著 “anti-SOCS-1 (CIS1)"。雜交瘤來源相同,只是不同批次標簽。實驗室若已有 sc-7005,再下單 “anti-CISH1" 新貨號 sc-514022 會拿到同一株克隆,重復花費 2800 元。登錄 Antibody Registry 輸入 AB__2125223 可查注冊信息,避免重復購買。
部分老版本基因組瀏覽器把 CISH 寫成 CISH1,導致 siRNA 供應(yīng)商自動生成 “CISH1" 作為產(chǎn)品名。實際序列若靶向 3′UTR 的 CTGGAAAGCCTGACTGAA,在人類基因組比對 CISH,不會干擾其他 SOCS 成員。下單前把序列貼到 NCBI BLAST,確認 Off-target score < 5,再讓廠商把產(chǎn)品名改成 “CISH siRNA",避免文章里出現(xiàn)自相矛盾的符號。
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